Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Rbp4Q00724 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Rbp4Q00724 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms