Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Apoa1Q00623 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms