Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
AlkP97793 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
AlkP97793 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AlkP97793 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
AlkP97793 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AlkP97793 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AlkP97793 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AlkP97793 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
AlkP97793 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AlkP97793 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
AlkP97793 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AlkP97793 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AlkP97793 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AlkP97793 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AlkP97793 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AlkP97793 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
AlkP97793 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AlkP97793 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
AlkP97793 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AlkP97793 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AlkP97793 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AlkP97793 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AlkP97793 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AlkP97793 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AlkP97793 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AlkP97793 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AlkP97793 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AlkP97793 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AlkP97793 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AlkP97793 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AlkP97793 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
AlkP97793 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AlkP97793 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AlkP97793 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
AlkP97793 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AlkP97793 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AlkP97793 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AlkP97793 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AlkP97793 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AlkP97793 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
AlkP97793 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AlkP97793 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AlkP97793 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
AlkP97793 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AlkP97793 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AlkP97793 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AlkP97793 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
AlkP97793 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AlkP97793 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AlkP97793 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AlkP97793 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AlkP97793 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AlkP97793 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AlkP97793 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
AlkP97793 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AlkP97793 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AlkP97793 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AlkP97793 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AlkP97793 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AlkP97793 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AlkP97793 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AlkP97793 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
AlkP97793 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AlkP97793 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AlkP97793 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AlkP97793 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AlkP97793 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AlkP97793 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AlkP97793 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AlkP97793 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AlkP97793 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AlkP97793 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AlkP97793 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AlkP97793 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
AlkP97793 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AlkP97793 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AlkP97793 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AlkP97793 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AlkP97793 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
AlkP97793 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
AlkP97793 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AlkP97793 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AlkP97793 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AlkP97793 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AlkP97793 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AlkP97793 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AlkP97793 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AlkP97793 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AlkP97793 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AlkP97793 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AlkP97793 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AlkP97793 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AlkP97793 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AlkP97793 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AlkP97793 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AlkP97793 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AlkP97793 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AlkP97793 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
AlkP97793 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
AlkP97793 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms