Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited1P97769 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited1P97769 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited1P97769 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited1P97769 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited1P97769 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited1P97769 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited1P97769 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited1P97769 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited1P97769 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited1P97769 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited1P97769 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited1P97769 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited1P97769 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cited1P97769 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms