Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Mesp1P97309 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms