Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SgcdP82347 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SgcdP82347 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcdP82347 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcdP82347 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcdP82347 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcdP82347 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcdP82347 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcdP82347 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcdP82347 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcdP82347 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcdP82347 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SgcdP82347 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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