Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Ptprn2P80560 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptprn2P80560 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ptprn2P80560 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptprn2P80560 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ptprn2P80560 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptprn2P80560 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ptprn2P80560 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ptprn2P80560 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptprn2P80560 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptprn2P80560 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ptprn2P80560 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ptprn2P80560 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ptprn2P80560 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptprn2P80560 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptprn2P80560 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptprn2P80560 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptprn2P80560 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ptprn2P80560 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptprn2P80560 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptprn2P80560 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptprn2P80560 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptprn2P80560 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptprn2P80560 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptprn2P80560 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptprn2P80560 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptprn2P80560 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptprn2P80560 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptprn2P80560 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ptprn2P80560 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptprn2P80560 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptprn2P80560 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptprn2P80560 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptprn2P80560 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptprn2P80560 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ptprn2P80560 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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