Protein–RNA interactions for Protein: P70658

Cxcr4, C-X-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr4P70658 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cxcr4P70658 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms