Protein–RNA interactions for Protein: P70424

Erbb2, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erbb2P70424 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Erbb2P70424 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms