Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

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Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Tp53bp1P70399 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Tp53bp1P70399 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Tp53bp1P70399 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Tp53bp1P70399 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Tp53bp1P70399 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Tp53bp1P70399 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tp53bp1P70399 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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