Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Usp9xP70398 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Usp9xP70398 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Usp9xP70398 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Usp9xP70398 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms