Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PrkcbP68404 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms