Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snrpd1P62315 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Snrpd1P62315 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Snrpd1P62315 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Snrpd1P62315 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Snrpd1P62315 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snrpd1P62315 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snrpd1P62315 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snrpd1P62315 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snrpd1P62315 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snrpd1P62315 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snrpd1P62315 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snrpd1P62315 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snrpd1P62315 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snrpd1P62315 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snrpd1P62315 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snrpd1P62315 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snrpd1P62315 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snrpd1P62315 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snrpd1P62315 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Snrpd1P62315 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Snrpd1P62315 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snrpd1P62315 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snrpd1P62315 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snrpd1P62315 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snrpd1P62315 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snrpd1P62315 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snrpd1P62315 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms