Protein–RNA interactions for Protein: P62192

Psmc1, 26S proteasome regulatory subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc1P62192 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmc1P62192 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms