Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ufm1P61961 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms