Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Vbp1P61759 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Vbp1P61759 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Vbp1P61759 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Vbp1P61759 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Vbp1P61759 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Vbp1P61759 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Vbp1P61759 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Vbp1P61759 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Vbp1P61759 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Vbp1P61759 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vbp1P61759 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Vbp1P61759 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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