Protein–RNA interactions for Protein: P60824

Cirbp, Cold-inducible RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CirbpP60824 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CirbpP60824 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CirbpP60824 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CirbpP60824 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
CirbpP60824 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms