Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ppfia3P60469 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ppfia3P60469 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms