Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps5P59438 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps5P59438 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps5P59438 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps5P59438 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hps5P59438 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hps5P59438 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps5P59438 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps5P59438 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hps5P59438 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms