Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scarf2P59222 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scarf2P59222 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms