Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd4P58467 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Setd4P58467 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Setd4P58467 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Setd4P58467 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms