Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Samsn1P57725 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Samsn1P57725 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms