Protein–RNA interactions for Protein: P56656

Cyp2c39, Cytochrome P450 2C39, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c39P56656 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cyp2c39P56656 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms