Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
GferP56213 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
GferP56213 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
GferP56213 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
GferP56213 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
GferP56213 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
GferP56213 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
GferP56213 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
GferP56213 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
GferP56213 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
GferP56213 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
GferP56213 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
GferP56213 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
GferP56213 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
GferP56213 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GferP56213 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GferP56213 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
GferP56213 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GferP56213 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GferP56213 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GferP56213 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GferP56213 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GferP56213 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
GferP56213 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GferP56213 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GferP56213 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
GferP56213 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GferP56213 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
GferP56213 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GferP56213 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GferP56213 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
GferP56213 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
GferP56213 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GferP56213 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
GferP56213 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
GferP56213 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GferP56213 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
GferP56213 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
GferP56213 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
GferP56213 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GferP56213 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
GferP56213 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
GferP56213 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
GferP56213 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GferP56213 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GferP56213 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GferP56213 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GferP56213 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GferP56213 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GferP56213 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
GferP56213 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
GferP56213 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
GferP56213 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
GferP56213 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
GferP56213 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
GferP56213 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
GferP56213 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
GferP56213 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
GferP56213 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
GferP56213 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
GferP56213 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GferP56213 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GferP56213 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GferP56213 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GferP56213 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GferP56213 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GferP56213 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GferP56213 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GferP56213 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GferP56213 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GferP56213 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GferP56213 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GferP56213 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GferP56213 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GferP56213 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GferP56213 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GferP56213 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GferP56213 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GferP56213 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GferP56213 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
GferP56213 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GferP56213 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GferP56213 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
GferP56213 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GferP56213 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GferP56213 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GferP56213 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
GferP56213 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GferP56213 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GferP56213 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
GferP56213 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GferP56213 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GferP56213 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GferP56213 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GferP56213 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GferP56213 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GferP56213 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
GferP56213 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GferP56213 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
GferP56213 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms