Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NcanP55066 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NcanP55066 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NcanP55066 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NcanP55066 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NcanP55066 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NcanP55066 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NcanP55066 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NcanP55066 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NcanP55066 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NcanP55066 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NcanP55066 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NcanP55066 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NcanP55066 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NcanP55066 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NcanP55066 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
NcanP55066 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NcanP55066 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NcanP55066 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NcanP55066 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NcanP55066 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NcanP55066 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NcanP55066 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NcanP55066 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NcanP55066 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NcanP55066 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NcanP55066 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NcanP55066 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NcanP55066 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NcanP55066 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NcanP55066 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NcanP55066 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NcanP55066 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NcanP55066 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
NcanP55066 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NcanP55066 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcanP55066 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcanP55066 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NcanP55066 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcanP55066 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcanP55066 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcanP55066 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcanP55066 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcanP55066 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NcanP55066 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcanP55066 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcanP55066 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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NcanP55066 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcanP55066 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcanP55066 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NcanP55066 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NcanP55066 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NcanP55066 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcanP55066 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NcanP55066 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcanP55066 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcanP55066 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcanP55066 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcanP55066 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcanP55066 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcanP55066 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NcanP55066 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcanP55066 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NcanP55066 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NcanP55066 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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NcanP55066 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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NcanP55066 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NcanP55066 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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NcanP55066 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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NcanP55066 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NcanP55066 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NcanP55066 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.06■□□□□ 0
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NcanP55066 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NcanP55066 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NcanP55066 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NcanP55066 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NcanP55066 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NcanP55066 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NcanP55066 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NcanP55066 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NcanP55066 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NcanP55066 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NcanP55066 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NcanP55066 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NcanP55066 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NcanP55066 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NcanP55066 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms