Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NrlP54846 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NrlP54846 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NrlP54846 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NrlP54846 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NrlP54846 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NrlP54846 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NrlP54846 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NrlP54846 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NrlP54846 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NrlP54846 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NrlP54846 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NrlP54846 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NrlP54846 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NrlP54846 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NrlP54846 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NrlP54846 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NrlP54846 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NrlP54846 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NrlP54846 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NrlP54846 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NrlP54846 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NrlP54846 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NrlP54846 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NrlP54846 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NrlP54846 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NrlP54846 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NrlP54846 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NrlP54846 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NrlP54846 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NrlP54846 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NrlP54846 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NrlP54846 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NrlP54846 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NrlP54846 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NrlP54846 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NrlP54846 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NrlP54846 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NrlP54846 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NrlP54846 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NrlP54846 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NrlP54846 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NrlP54846 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NrlP54846 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NrlP54846 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NrlP54846 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NrlP54846 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NrlP54846 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NrlP54846 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NrlP54846 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NrlP54846 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NrlP54846 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NrlP54846 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NrlP54846 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NrlP54846 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NrlP54846 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NrlP54846 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NrlP54846 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NrlP54846 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NrlP54846 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NrlP54846 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NrlP54846 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NrlP54846 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NrlP54846 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NrlP54846 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NrlP54846 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NrlP54846 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NrlP54846 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NrlP54846 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NrlP54846 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NrlP54846 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NrlP54846 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NrlP54846 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NrlP54846 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NrlP54846 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NrlP54846 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NrlP54846 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NrlP54846 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NrlP54846 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NrlP54846 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NrlP54846 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NrlP54846 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NrlP54846 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NrlP54846 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NrlP54846 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NrlP54846 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NrlP54846 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NrlP54846 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NrlP54846 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NrlP54846 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NrlP54846 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NrlP54846 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NrlP54846 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NrlP54846 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NrlP54846 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NrlP54846 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NrlP54846 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NrlP54846 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NrlP54846 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NrlP54846 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms