Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfP51642 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfP51642 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfP51642 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfP51642 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfP51642 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfP51642 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfP51642 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfP51642 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfP51642 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfP51642 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfP51642 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfP51642 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfP51642 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfP51642 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfP51642 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfP51642 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfP51642 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfP51642 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfP51642 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfP51642 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfP51642 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfP51642 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfP51642 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfP51642 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfP51642 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfP51642 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CntfP51642 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfP51642 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfP51642 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfP51642 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfP51642 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfP51642 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfP51642 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfP51642 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfP51642 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfP51642 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfP51642 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfP51642 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfP51642 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfP51642 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfP51642 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfP51642 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfP51642 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfP51642 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfP51642 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfP51642 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfP51642 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfP51642 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfP51642 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfP51642 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfP51642 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfP51642 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfP51642 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfP51642 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfP51642 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfP51642 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfP51642 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfP51642 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfP51642 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfP51642 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfP51642 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfP51642 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfP51642 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfP51642 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfP51642 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfP51642 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfP51642 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfP51642 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfP51642 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfP51642 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfP51642 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfP51642 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CntfP51642 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CntfP51642 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CntfP51642 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CntfP51642 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CntfP51642 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CntfP51642 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CntfP51642 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CntfP51642 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CntfP51642 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CntfP51642 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CntfP51642 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CntfP51642 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CntfP51642 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CntfP51642 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CntfP51642 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CntfP51642 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CntfP51642 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CntfP51642 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CntfP51642 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CntfP51642 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CntfP51642 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CntfP51642 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CntfP51642 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CntfP51642 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CntfP51642 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CntfP51642 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CntfP51642 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms