Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa11P50709 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa11P50709 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa11P50709 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa11P50709 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa11P50709 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa11P50709 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa11P50709 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa11P50709 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms