Protein–RNA interactions for Protein: P50636

Rnf19a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF19A, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf19aP50636 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf19aP50636 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf19aP50636 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf19aP50636 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf19aP50636 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf19aP50636 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf19aP50636 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf19aP50636 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf19aP50636 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf19aP50636 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf19aP50636 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf19aP50636 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf19aP50636 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf19aP50636 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf19aP50636 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf19aP50636 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf19aP50636 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf19aP50636 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf19aP50636 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf19aP50636 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf19aP50636 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf19aP50636 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf19aP50636 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf19aP50636 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf19aP50636 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf19aP50636 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf19aP50636 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf19aP50636 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf19aP50636 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf19aP50636 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf19aP50636 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf19aP50636 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf19aP50636 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf19aP50636 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf19aP50636 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf19aP50636 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf19aP50636 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf19aP50636 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf19aP50636 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf19aP50636 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf19aP50636 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf19aP50636 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf19aP50636 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf19aP50636 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf19aP50636 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf19aP50636 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf19aP50636 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf19aP50636 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf19aP50636 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf19aP50636 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf19aP50636 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf19aP50636 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf19aP50636 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf19aP50636 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf19aP50636 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf19aP50636 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf19aP50636 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf19aP50636 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf19aP50636 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf19aP50636 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf19aP50636 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf19aP50636 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf19aP50636 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf19aP50636 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf19aP50636 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf19aP50636 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf19aP50636 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf19aP50636 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf19aP50636 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf19aP50636 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf19aP50636 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf19aP50636 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf19aP50636 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf19aP50636 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf19aP50636 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf19aP50636 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf19aP50636 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf19aP50636 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf19aP50636 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf19aP50636 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf19aP50636 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf19aP50636 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf19aP50636 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf19aP50636 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf19aP50636 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf19aP50636 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf19aP50636 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf19aP50636 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf19aP50636 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf19aP50636 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf19aP50636 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf19aP50636 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf19aP50636 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf19aP50636 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf19aP50636 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf19aP50636 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf19aP50636 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf19aP50636 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf19aP50636 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf19aP50636 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms