Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp3P49194 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbp3P49194 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms