Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnni3P48787 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnni3P48787 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms