Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LmnaP48678 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LmnaP48678 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LmnaP48678 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LmnaP48678 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LmnaP48678 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LmnaP48678 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LmnaP48678 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LmnaP48678 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LmnaP48678 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LmnaP48678 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LmnaP48678 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LmnaP48678 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LmnaP48678 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
LmnaP48678 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LmnaP48678 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LmnaP48678 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LmnaP48678 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LmnaP48678 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LmnaP48678 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LmnaP48678 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LmnaP48678 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LmnaP48678 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LmnaP48678 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LmnaP48678 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LmnaP48678 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LmnaP48678 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LmnaP48678 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms