Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VdrP48281 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VdrP48281 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VdrP48281 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VdrP48281 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VdrP48281 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VdrP48281 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VdrP48281 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
VdrP48281 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VdrP48281 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VdrP48281 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VdrP48281 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VdrP48281 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VdrP48281 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VdrP48281 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VdrP48281 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VdrP48281 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VdrP48281 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VdrP48281 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VdrP48281 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VdrP48281 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
VdrP48281 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VdrP48281 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VdrP48281 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VdrP48281 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VdrP48281 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
VdrP48281 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
VdrP48281 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VdrP48281 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VdrP48281 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VdrP48281 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VdrP48281 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VdrP48281 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VdrP48281 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VdrP48281 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VdrP48281 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VdrP48281 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VdrP48281 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VdrP48281 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VdrP48281 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VdrP48281 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VdrP48281 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VdrP48281 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VdrP48281 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VdrP48281 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VdrP48281 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VdrP48281 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VdrP48281 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VdrP48281 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VdrP48281 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VdrP48281 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VdrP48281 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VdrP48281 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VdrP48281 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VdrP48281 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VdrP48281 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VdrP48281 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VdrP48281 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VdrP48281 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VdrP48281 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VdrP48281 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VdrP48281 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VdrP48281 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VdrP48281 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VdrP48281 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VdrP48281 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VdrP48281 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VdrP48281 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VdrP48281 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VdrP48281 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VdrP48281 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VdrP48281 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VdrP48281 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VdrP48281 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VdrP48281 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VdrP48281 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VdrP48281 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VdrP48281 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VdrP48281 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VdrP48281 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VdrP48281 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VdrP48281 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VdrP48281 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VdrP48281 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VdrP48281 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VdrP48281 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VdrP48281 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VdrP48281 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VdrP48281 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VdrP48281 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VdrP48281 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VdrP48281 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VdrP48281 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VdrP48281 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VdrP48281 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VdrP48281 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VdrP48281 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VdrP48281 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VdrP48281 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VdrP48281 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms