Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gbx2P48031 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbx2P48031 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms