Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdc2P43407 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdc2P43407 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms