Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gdf5P43027 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms