Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sept1P42209 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sept1P42209 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sept1P42209 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sept1P42209 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sept1P42209 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sept1P42209 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sept1P42209 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sept1P42209 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sept1P42209 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sept1P42209 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sept1P42209 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sept1P42209 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms