Protein–RNA interactions for Protein: P40694

Ighmbp2, DNA-binding protein SMUBP-2, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighmbp2P40694 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ighmbp2P40694 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms