Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprkP35822 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprkP35822 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprkP35822 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprkP35822 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprkP35822 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprkP35822 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprkP35822 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprkP35822 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprkP35822 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprkP35822 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtprkP35822 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprkP35822 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprkP35822 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms