Protein–RNA interactions for Protein: P35546

Ret, Proto-oncogene tyrosine-protein kinase receptor Ret, mousemouse

Predictions only

Length 1,115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RetP35546 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RetP35546 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RetP35546 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RetP35546 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RetP35546 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RetP35546 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RetP35546 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RetP35546 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RetP35546 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RetP35546 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RetP35546 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RetP35546 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RetP35546 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RetP35546 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RetP35546 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RetP35546 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RetP35546 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RetP35546 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RetP35546 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RetP35546 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RetP35546 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RetP35546 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RetP35546 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RetP35546 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RetP35546 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RetP35546 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RetP35546 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RetP35546 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RetP35546 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RetP35546 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RetP35546 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RetP35546 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RetP35546 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RetP35546 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RetP35546 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RetP35546 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RetP35546 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RetP35546 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RetP35546 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RetP35546 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RetP35546 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RetP35546 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RetP35546 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RetP35546 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RetP35546 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RetP35546 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RetP35546 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RetP35546 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RetP35546 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RetP35546 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RetP35546 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RetP35546 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RetP35546 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RetP35546 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RetP35546 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RetP35546 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RetP35546 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RetP35546 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RetP35546 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RetP35546 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RetP35546 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RetP35546 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RetP35546 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RetP35546 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RetP35546 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RetP35546 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RetP35546 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RetP35546 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RetP35546 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RetP35546 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RetP35546 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RetP35546 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RetP35546 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RetP35546 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RetP35546 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RetP35546 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RetP35546 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RetP35546 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RetP35546 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RetP35546 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RetP35546 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RetP35546 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RetP35546 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RetP35546 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RetP35546 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RetP35546 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RetP35546 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RetP35546 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RetP35546 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RetP35546 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RetP35546 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RetP35546 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RetP35546 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RetP35546 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RetP35546 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RetP35546 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RetP35546 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RetP35546 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RetP35546 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RetP35546 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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