Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin1P35438 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin1P35438 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Grin1P35438 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin1P35438 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin1P35438 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin1P35438 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin1P35438 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grin1P35438 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin1P35438 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms