Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpardP35396 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpardP35396 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpardP35396 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpardP35396 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpardP35396 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpardP35396 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PpardP35396 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpardP35396 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpardP35396 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpardP35396 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpardP35396 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpardP35396 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpardP35396 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpardP35396 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpardP35396 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpardP35396 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpardP35396 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpardP35396 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpardP35396 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpardP35396 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpardP35396 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpardP35396 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpardP35396 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpardP35396 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpardP35396 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpardP35396 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpardP35396 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PpardP35396 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpardP35396 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpardP35396 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpardP35396 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpardP35396 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpardP35396 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpardP35396 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpardP35396 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpardP35396 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpardP35396 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpardP35396 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpardP35396 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpardP35396 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpardP35396 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpardP35396 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpardP35396 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpardP35396 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PpardP35396 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpardP35396 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpardP35396 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpardP35396 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpardP35396 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpardP35396 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpardP35396 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpardP35396 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpardP35396 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpardP35396 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpardP35396 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpardP35396 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpardP35396 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PpardP35396 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PpardP35396 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PpardP35396 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PpardP35396 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PpardP35396 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpardP35396 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpardP35396 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PpardP35396 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpardP35396 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpardP35396 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpardP35396 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PpardP35396 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PpardP35396 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PpardP35396 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PpardP35396 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PpardP35396 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PpardP35396 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PpardP35396 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PpardP35396 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PpardP35396 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PpardP35396 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PpardP35396 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PpardP35396 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PpardP35396 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PpardP35396 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PpardP35396 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PpardP35396 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PpardP35396 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PpardP35396 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PpardP35396 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PpardP35396 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PpardP35396 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PpardP35396 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PpardP35396 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PpardP35396 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PpardP35396 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PpardP35396 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PpardP35396 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PpardP35396 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PpardP35396 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PpardP35396 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PpardP35396 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms