Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptk2P34152 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms