Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SsbP32067 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SsbP32067 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SsbP32067 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SsbP32067 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SsbP32067 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SsbP32067 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SsbP32067 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SsbP32067 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SsbP32067 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SsbP32067 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SsbP32067 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SsbP32067 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SsbP32067 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SsbP32067 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SsbP32067 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SsbP32067 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SsbP32067 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SsbP32067 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SsbP32067 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SsbP32067 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SsbP32067 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SsbP32067 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SsbP32067 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SsbP32067 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SsbP32067 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SsbP32067 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SsbP32067 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SsbP32067 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SsbP32067 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SsbP32067 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SsbP32067 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SsbP32067 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SsbP32067 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SsbP32067 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SsbP32067 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SsbP32067 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SsbP32067 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SsbP32067 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SsbP32067 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SsbP32067 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SsbP32067 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SsbP32067 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SsbP32067 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SsbP32067 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SsbP32067 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SsbP32067 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SsbP32067 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SsbP32067 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SsbP32067 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SsbP32067 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SsbP32067 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SsbP32067 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SsbP32067 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SsbP32067 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SsbP32067 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SsbP32067 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SsbP32067 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SsbP32067 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SsbP32067 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SsbP32067 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SsbP32067 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SsbP32067 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SsbP32067 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SsbP32067 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SsbP32067 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SsbP32067 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SsbP32067 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SsbP32067 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SsbP32067 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SsbP32067 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SsbP32067 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SsbP32067 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SsbP32067 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SsbP32067 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SsbP32067 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SsbP32067 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SsbP32067 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SsbP32067 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SsbP32067 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SsbP32067 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SsbP32067 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SsbP32067 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SsbP32067 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SsbP32067 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SsbP32067 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SsbP32067 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SsbP32067 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SsbP32067 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SsbP32067 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SsbP32067 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SsbP32067 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SsbP32067 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SsbP32067 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SsbP32067 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SsbP32067 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SsbP32067 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SsbP32067 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SsbP32067 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SsbP32067 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms