Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxc5P32043 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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