Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc10P31257 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc10P31257 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms