Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cd28P31041 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cd28P31041 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cd28P31041 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cd28P31041 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cd28P31041 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd28P31041 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cd28P31041 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms