Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp3P28862 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms