Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Hoxd10P28359 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Hoxd10P28359 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Hoxd10P28359 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Hoxd10P28359 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Hoxd10P28359 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Hoxd10P28359 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxd10P28359 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Hoxd10P28359 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd10P28359 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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