Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
U2af2P26369 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
U2af2P26369 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
U2af2P26369 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
U2af2P26369 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
U2af2P26369 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
U2af2P26369 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
U2af2P26369 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
U2af2P26369 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms